Les départements techniques sont des départements de production.
Ils ont pour mission essentielle la réalisation des projets et marchés confiée au BNETD en fonction de leur domaine d'intervention.
Ils contribuent à la valorisation de l'expertise du BNETD et à l'approvisionnement en ressources financières.
Les départements d'appui ont pour mission essentielle de mettre à la disposition des départements opérationnels leurs compétences selon le domaine d'intervention .
Ils contribuent à la valorisation de l'expertise du BNETD par un appui en terme de ressources humaines, de gestion financière, d'assistance juridique et d'amélioration de l'image de marque.